Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA2Q9UJY4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms