Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3LQ9UJW3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms