Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms