Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX25Q9UHL0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms