Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALPQ9UBC7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALPQ9UBC7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms