Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms