Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCNT4Q9P109 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms