Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms