Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR7Q9NYK1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms