Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2AIPQ9NXV6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms