Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDAP2Q9NXN4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms