Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BSDC1Q9NW68 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms