Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM28Q9NW13 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM28Q9NW13 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms