Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC17Q9NVM6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms