Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms