Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT82Q9NSB4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms