Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms