Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CNNM1Q9NRU3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms