Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms