Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL28Q9NRJ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms