Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XPNPEP3Q9NQH7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms