Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms