Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC17Q9NP64 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms