Protein–RNA interactions for Protein: Q9H999

PANK3, Pantothenate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK3Q9H999 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PANK3Q9H999 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK3Q9H999 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK3Q9H999 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms