Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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