Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms