Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms