Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXF3Q9H4D5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms