Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms