Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms