Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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HOXD1Q9GZZ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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HOXD1Q9GZZ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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HOXD1Q9GZZ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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