Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms