Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM4Q9C037 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms