Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM5Q9C035 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms