Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMES1Q9C002 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms