Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms