Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSD3Q9BZ95 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms