Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC46A2Q9BY10 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC46A2Q9BY10 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms