Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A5Q9BY07 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A5Q9BY07 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms