Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
BRIP1Q9BX63 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms