Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL6Q9BWW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms