Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms