Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms