Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms