Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RETNLBQ9BQ08 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms