Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms