Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms