Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF1Q96T88 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UHRF1Q96T88 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms