Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK1Q96SB4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK1Q96SB4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms