Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3IPQ96QF0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms